RIP-seq伯远生物深耕RNA免疫共沉淀测序

国家级专精特新小巨人企业国家级重点实验室 科研技术人员500硕博占比40%以上 15年技术沉淀每年完成功能基因研究数量50000长期服务课题组10000含协和、同济、华西、湘雅、中山、军事医学院等顶尖医学研究机构 功能基因研究综合性平台 各类仪器设备投资超1个亿 牵头多项省部级重大专项伯远生物致力于为科研客户提供高标准机制研究整体解决方案围绕RIP技术构建完整技术闭环覆盖课题设计、实验执行、多组学整合分析及论文支持全流程助力高水平科研成果产出。在机制研究层面伯远生物已建立标准化SOP体系并与多家三甲医院开展深度合作能够承接高难度机制类课题。通过整合RIP、RNA Pull-down、ChIP及双荧光素酶报告系统实现从分子互作筛选到功能验证的闭环实验设计有效提升课题完整性与说服力满足高水平期刊发表需求。在多组学研究方面依托自主研发的伯远云平台可实现转录组、蛋白组及单细胞等三维以上数据的联动分析支持RIP-seq与RNA-seq、蛋白组数据的深度整合如差异peak基因与差异表达基因交集分析显著增强机制解析深度。目前已成功助力多个多组学项目发表SCI论文。在服务能力方面伯远生物已服务全球110多个国家和地区客户具备大规模项目执行经验。RIP-seq结合RNA-seq的关联分析体系已高度标准化适用于队列研究及系统性研究课题。在技术平台方面公司深耕RIP技术近十年建立了严格的质量控制体系并配备自有质谱平台用于关键产物验证确保实验结果的可靠性与重复性。所有项目均可根据客户需求进行高度定制并提供从实验到投稿的全流程服务支持。此外伯远生物在植物与微生物领域同样具备丰富经验拥有大量RIP-seq成功案例可为相关方向研究提供稳定、高效的技术支撑。针对小规模项目如10个样本以内可实现约40天快速交付。伯远生物以“技术闭环多组学整合”为核心竞争力致力于成为高水平机制研究与高分文章产出的可靠合作伙伴。背景说明该技术的原理基于抗原-抗体的特异性结合通过目标蛋白的特异性抗体捕获细胞内的RNA-RBP复合物经磁珠沉淀、洗涤去除非特异性结合后分离纯化结合的RNA片段再通过高通量测序分析其序列信息结合生物信息学分析如Peak Calling筛选显著富集的RNA结合区域。实验过程中常使用甲醛交联固定RNA-蛋白相互作用以维持复合物稳定性并通过设置阴性对照如IgG抗体和阳性对照验证抗体特异性。RIP-seq技术广泛应用于研究转录因子、RNA结合蛋白等与RNA的相互作用为理解基因表达调控机制提供了重要工具。图 RIP技术流程Gagliardi M and Matarazzo M R., 2016。服务流程客户在线下单——订单/实验材料确认——样品准备——抗体沉淀蛋白-RNA复合物——免疫质控——解交联并纯化RNA片段——文库构建——文库质控——Illumina平台上机测序——生信分析——数据质控——结果交付服务内容及说明技术优势1、全转录组覆盖可系统性筛选所有与目标蛋白结合的RNA分子包括低丰度RNA2、高灵敏度与精确性通过百万级测序标签和高信噪比数据准确区分真实结合事件与背景噪音3、灵活性支持多种RNA类型mRNA、lncRNA、miRNA等和样本类型细胞、组织、肿瘤等。适用场景1、RNA结合蛋白的功能研究系统性筛选与特定RBP结合的RNA分子如mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA等揭示其在剪接、稳定性或翻译调控中的作用2、RNA修饰酶的靶点分析鉴定RNA修饰酶如m6A甲基化酶、去甲基化酶或阅读蛋白的靶点揭示修饰动态与功能关联3、解析调控机制揭示疾病如癌症中RNA-蛋白互作网络与转录组或其他表观组学整合揭示转录后调控与表观遗传网络的交叉作用。